核爆，场景化为灼热的橙黄。
在一片混乱中，一个男人，怀中抱着一个小女孩，蹒跚着前进。
他颤颤巍巍将她放入救生舱，随后栽倒在了舱体上……
热流中，使徒在地球上张开金色的光翼，冲破云层，气吞山河。
这场面犹如诺亚洪水、又如摩西襁褓在漂流于尼罗河中意象；
天似乎破了两个大洞，光柱如金色银河直落九天。
这是就美里眼中的【第二次冲击】。
仿佛神话意蕴中的末日图景，是诺亚时代的大洪水，是女娲补天。还有十字架这个意象，不停地反复出现。
画面一转，15年后，那个弱小的女孩长大了，成熟了。
可美里胸口处的伤疤还在，痛苦也依旧还在。
时间随着这道疤，回到了现在。
美里从上尉晋升为了少校，众人纷纷前来祝贺。
真嗣在与EVA的精神共振实验中进步斐然，得到了律子的夸赞。
而明日香则再次讥讽他，真嗣实在不明白为何她会有这么大的反应……此时，心中高兴的他感觉自己好像找到了作为EVA驾驶员的意义。
会是明日香口中的“为了得到夸赞与认可”这个原因吗？
这段时间，他的父亲碇源堂前往南极调查，总部由美里接管指挥。
整个南极亦是一片红海，白色的岩柱如长杆耸立。
“这场景，好像《恶魔人》中最后的末日啊！”
“毕竟是一个作者嘛~（笑）”
曾经的《恶魔人》粉丝没有放过这一幕……
现在，这是生命无法生存的地方，死亡的世界——南极。
碇源堂自负的站在行驶的军舰上，声称人类可以凭借自己创造的科技力量，立足于此。
而冬月副司令提醒道：正是这种傲慢造成了第二次冲击。
碇司令说，污染正在消除，世界正在进化。
“即使充满了罪恶，我还是期望一个有人类存在的世界。”
这一席对话，使不少“反派党”为其辩护。
-或许一切的不择手段都是为了全人类。
-没错，大人的责任与担当，与小孩那种只顾自己心情的做法是不一样的。
……
碇司令出差期间，使徒再度来袭，这一次的敌人是——大眼仔空天使。
空天使创新应用AT力场，不仅破坏了扫描监控，还能利用自由落体原理，将其作为“投空炮弹”向地球进攻。
空天使显然是奔着基地而来。
美里首先下令撤退，城市降入地下。
而她想出来的作战计划，竟然是让三台EVA在它降落时徒手抵挡，正面迎击，其胜率只有万分之一。
连律子都觉得太过冒险，指责美里是“出于私心”，只是为了为父亲报仇。
不过真嗣和香香却因为一顿牛排，乐呵呵的同意了……
根据Mac计算机的推测，系统估出了一个大概地点，美里把三台EVA布置在了三个圆的中心点。
作战开始，出发。
真嗣、绫波丽、明日香三人乘坐电梯。
一瞬间，三人的并排而立的背影前，是三台EVA侧脸的同框。
这张画面构图令人叹为观止，三位英勇的战士，一齐面对与自己同生共死的EVA，此刻的它们信任无间，仿佛一体。
真嗣驾驶初号机在山间待命，他不禁回想起跟美里的谈话……
“真嗣昨天不是问过，我为什么要加入Nerv组织吗？”
“我的父亲，是一个活在自己研究，活在自己梦想里的人。
我始终不能够原谅这样的他，甚至是憎恨……”
真嗣对此深有同感……
“他对我和妈妈还有家里的事情完全置之不理。周围的朋友都说他是个细心的人。
但真正的他很软弱，逃避现实，逃避家人，像一个孩子一样。
所以当母亲提出离婚的时候，我不假思索的同意了。父亲像是受到了巨大的打击，却笑着说是自己自作自受……”
可是，这样的父亲却在第二次冲击中，为保护美里而死……
美里不明白，自己究竟对父亲是爱还是恨……
而她加入Nerv的理由，似乎只是为了替父亲复仇。
“从父亲的束缚中挣脱出来……”
美里说出的这句话，使真嗣下定决心，绝不逃避，像美里一样战斗到底。
突然，目标出现，使徒快速接近。
距离地面2万米时，所有EVA同时奔向降落地点！
伴随着“锵锵”连击，地面不断震动，真嗣超音速疾速飞驰，几个帅气的跃身，率先到达使徒降落中心！
“力场全开！”
万丈光芒下，地面房屋霎时间被扫荡尽毁。
唯有初号机顶天立地，双手硬抗冲击，在使徒自身体重、万有引力、AT力场的作用力之下坚强支撑。
零号机、二号机紧随其后，力场全开，共同支撑。
就是现在，香香出刀，一刀刺穿使徒核心！
空天使倒下，随即又是一场超华丽的核爆，不过战