魏衡的师傅是百花谷曾经的一位医圣黎瓤，他是黎瀚之唯一的叔父，因为不喜束缚擅自离谷还把谷主之位让给了侄子。游历到云阳县时遇到痴迷医术的魏衡，主动要求做他师傅。
因为魏衡并未染病，其他大夫不允许他的自杀行为。医学史上不允许平白无故死去一人，更何况他是他们的主心骨，这场灾难除了他没人能制止，师徒二人的研究成果他人无法触及。
人终究是要离开的，若是能保住一命是极好的，即便失败那也为医学的成功做出了巨大贡献，他们会引以为豪。其他大夫说服了自己的家人参与试药，魏衡的父母也主动申请加入，但姐姐魏薇却坚决反对，她知道弟弟眼里只有医学。
魏薇的反对无效，他们姐弟的父母最后还是参与了试错的行列，与其他大夫的家人一起，一共二十三人，每个人都带着决心奔赴前线。
试验的过程艰难而漫长，第一批死亡的人数有三人，其中就包括魏父，魏薇为此带着百姓大闹防疫站抗议。大夫们置若罔闻，他们还有更重要的事情要处理。
这段时间是最难熬的时候，死亡病例、群民抗议和毫无进展带来的压力，让每个人的精神都崩到了极致。
大夫们喝着药坚持做完了试验，三个疗程后只剩下十六人。魏母身体素质不错，恢复之时指日可待，但医学研究要成功并非易事！
在试验完的第三个晚上，为了验证是否真的痊愈，魏衡研制了一种回还丹。若痊愈吃下去身体并无大碍，反之则会有生命危险。他将危险性跟所有人明言，要不要尝试看个人意愿。意外的是，每个人都很乐意地接受了，他们早就有为了成功做出牺牲的准备。
事实证明他们太乐观了，翌日有一半的人在用饭时当场暴毙，因为药物起了排斥反应。异变来得猝不及防，本来活蹦乱跳的一个人，下一刻就瘫倒在地开始不断咳血，魏母还是意外去世了。
来不及悲伤，魏衡继续开始下一步的研究。十二位医者，六位幸存者，历经十三个日夜，终于找出了问题所在。排除掉障碍后，接下来陆续有人愿意加入试药的行列，这结果既让人欣慰又令人悲伤。
魏衡给病者用了另外一种改良后的新药。期间还是出现了死亡的情况，但死亡率降下来挺多。两百零八天，治疗鼠疫的解药终于研制成功，云阳县的人都脱离了危险，三日后都成功逃出鬼门关。
魏衡突然想起了自己的父母，还有那些为了医学付出了宝贵生命人，他们是世人尊敬的对象。他怀着沉重的心情回了家，魏衡已经离家整整一年，虽然同在一个镇上，但他还是很想念姐姐。
意料之外的是，魏薇早就和他断绝了姐弟关系，桌上满满一篮都是她控诉弟弟恶鬼行径的口水。那些是在半年前留下的，姐姐已经离开这么久了！
每一封信魏衡都忍着悲痛看完了，因为他做出的荒谬之举，害得很多人家破人亡，魏家每日都在被唾弃。姐姐恨他让魏家成了全镇的“仇人”，恨他为了自己的私欲让这么多人陪葬，更恨他让她忍受父母离世的痛苦！
魏薇知道弟弟受了很多苦，他能振作家里人都很高兴，可魏衡完全在沉浸在医学中，简直到了疯魔的地步。有一次几乎让自己丧命，因为他大脑过度疲劳差点窒息，幸好他命大并无大碍。
魏衡醒来却更加疯狂地投入医学研究，恍若不知自己曾身陷危险，魏衡认为他是接近疯子的存在。她没想到的是，弟弟为了医学研究居然要父母去送死，这是她绝不能接受的。
无论他做这一切是为了什么，魏薇不明白也不想明白，她只是想家人平安而已。因此，魏衡决定与魏衡老死不相往来，之后留下一封决绝信远走他乡，从此不知所踪了。家人的离开无疑给魏衡造成了很大的打击，但更大的磨难还在后边。
鼠疫给云阳降临了长达三年的阴影，第三年的疫情尤其严重，魏衡也是在这时才开始研制解药的。直到如今，作为主医师的魏衡，带领十一个比他资质高得多的大夫，成功救回患病的云阳县人。
但除了魏衡，所有医者都在第一时间举家迁移到了其他城镇。很多试药者是瞒着家人过来的，他们认为是魏衡迷惑那些人自寻死路的。因为“罪魁祸首”只剩下魏衡，因此在阴云散去后他们都跑到魏家找他算账。
因鼠疫而病死者的亲友也都责怪他们为何不早制出解药，魏衡脸上的胎记被拿来说事：魏衡是瘟神，是他引来的鼠疫。
众人无理取闹的报复开始了，曾救助过他们的恩人却被当成恶煞任意践踏，每当有人不开心就会对他拳打脚踢，幼童们也都毫无节制地对他恶作剧……简直把他当成了这场灾难的凶手。